蘇北淺灘生態(tài)監(jiān)控區(qū) 生態(tài)系統(tǒng)處于亞健康狀態(tài)。水體氮磷比失衡，局部水域活性磷酸鹽含量超第四類海水水質(zhì)標準。近10%海域沉積物中硫化物含量超第一類海洋沉積物質(zhì)量標準。部分生物體內(nèi)鉛含量偏高。生物群落結(jié)構(gòu)狀況一般，春季，浮游植物密度偏低，平均為3.4×104個細胞/立方米；春季和夏季，浮游動物密度明顯偏低，平均值分別為2 504個/立方米和2 278個/立方米；魚卵、仔魚平均密度分別為4個/立方米和45尾/立方米。
連續(xù)五年的監(jiān)測結(jié)果表明，蘇北淺灘生態(tài)系統(tǒng)健康狀況總體處于穩(wěn)定狀態(tài)。水體氮磷含量呈下降趨勢，但水環(huán)境質(zhì)量指數(shù)波動較大，水體富營養(yǎng)化、氮磷比失衡現(xiàn)象依然存在。底棲生物棲息密度和生物量始終偏低，尤其是潮間帶生物資源衰退等生態(tài)問題仍然嚴重。灘涂圍墾、陸源排污和過度捕撈等是威脅蘇北淺灘濕地生態(tài)系統(tǒng)健康的主要因素。
長江口生態(tài)監(jiān)控區(qū) 生態(tài)系統(tǒng)處于亞健康狀態(tài)。水體富營養(yǎng)化嚴重，氮磷比嚴重失衡，春季和夏季，大部分水域無機氮和活性磷酸鹽含量超第四類海水水質(zhì)標準。全部生物殘毒檢測樣品中石油烴和鉛含量偏高，部分生物體內(nèi)砷、鎘和總汞含量偏高。生物群落結(jié)構(gòu)異常，生物多樣性和均勻度較差，夏季浮游植物密度偏高，平均為6 719×104個細胞/立方米，生物多樣性指數(shù)平均為1.71，均勻度平均為0.39；春季浮游動物密度偏低，平均為1 346個/立方米；春季底棲生物棲息密度偏高，為191個/平方米，生物多樣性指數(shù)平均為1.95，均勻度平均為0.69；魚卵、仔魚密度低，平均密度分別為0.34個/百立方米和6尾/百立方米。
連續(xù)五年的監(jiān)測結(jié)果表明，長江口生態(tài)系統(tǒng)健康狀況總體穩(wěn)定，但始終處于不健康和亞健康之間的臨界狀態(tài)。長江口水體富營養(yǎng)化、氮磷比失衡嚴重，水體溶解氧含量呈下降趨勢，局部出現(xiàn)溶解氧低于2毫克/升的低氧區(qū)。部分生物體內(nèi)銅、鋅、砷、鎘和鉛含量偏高。長江口生物群落結(jié)構(gòu)狀況總體上仍然較差，長江沖淡水區(qū)域生物群落結(jié)構(gòu)基本保持穩(wěn)定；長江口門以內(nèi)區(qū)域生物群落結(jié)構(gòu)趨于簡單，生物種類減少，生物多樣性降低；漁業(yè)生物資源衰退等生態(tài)問題嚴重。陸源排污、長江來水量不足、各類海洋海岸工程建設和灘涂圍墾等是威脅長江口生態(tài)系統(tǒng)健康的主要因素。
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