認同漸進改革
由于其思想體系中對要素稟賦的強調，林毅夫的整體發展戰略思想中產權改革并不處于核心內容。
在總結東歐等轉軌國家的經驗之后，他也反對“休克療法”，主張漸進式的改革，因此他的學術思想也在很大程度上被認為相對承認歷史現實，為政府漸進式改革提供了空間。
按西方的理論，國有企業改革的核心在于國有制度。林毅夫則認為，產權是否私有與企業自生能力并無必然關系，“市場先于產權”是“企業自生能力”這一理論成立的前提，他發現的國有企業的關鍵問題不在產權，而在于其政策性負擔，“只有把政策性負擔剝離，才能談到產權改革”。
按照他的觀點，私有化并不能解決問題，問題的關鍵在于市場是否透明有效。國有企業的委托代理，并不能斷言就是無效的，而在針對楊小凱提出“后發劣勢”等理論界的論戰中，林毅夫利用其資源稟賦學術，從比較優勢觀點來支持中國的漸進式改革。
對于中國經濟發展的奇跡，他抱有極大的期望。他認為中國改革開放以來奇跡式的經濟增長速度很可能再保持二三十年，并認為中國未來甚至會趕上并超過美國，成為世界經濟的中心。本報記者 張誠
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