大部制向何處去，是現階段大部制改革的核心問題。
剛剛結束的中央黨校經濟學部舉辦的“中國經濟觀察雙月論壇”上，國家發改委、中央財經領導小組、國家煙草專賣局官員和專家學者就此問題展開了熱烈的討論。“大部委制與政府職能轉變”成為這次討論的主要議題。
“即將推開的機構改革，應在政府職能轉變方面多下工夫，以防止權力的橫向轉移。”一位與會官員提醒說。按照既定計劃，6月底前先期進行大部制試點的5個部門將完成定職能、定機構、定編制的“三定”工作。
而在3月25日的國務院廉政工作會議上，國務院總理溫家寶以“減少政府微觀干預”相呼應，給外界以樂觀期待。
發改委和煙草專賣局官員的對話
依照新一輪國務院機構改革方案，本次國務院系統涉及調整變動的機構共15個，正部級機構減少4個，原有的28個部委經過重組后減成27個。
“從國外經驗來看，實行大部委制的國家，其部委數量一般都不會超過20個。”寧夏自治區副主席張來武表示。
“我們現在是27個，仍然有點多，可以視作是改革的第一步。”張來武稱。
而另一位參加討論的發改委官員，則強調了另一方面：“我覺得數字不是主要的問題，最主要是看政府職能是不是到位。”
在這名國家發改委官員看來，要考慮到國內外政府組織結構的異同，最關鍵的是要厘定“市場與政府間定位的問題”。
政府在行政過程中所存在的“缺位、越位、錯位”的情況，一直為人所詬病。這名發改委官員介紹，以行政審批為例，今年上半年，國務院法制辦剛剛清理了一批行政審批事項，涉及到發改委的即達到三、四十項，整個國務院系統行政審批還要更多。
該官員表示，改革下一步“要注意減少行政審批事項”。
這名發改委官員在減少行政審批上的姿態，并沒有取得主動。在場的一名國家煙草專賣局官員當場回應說，煙草行業從農業、工業、商業、外貿再到市場監管都是一體化監管，國家煙草專賣局既是決策者又是執行者。但是，每年煙葉的種植計劃、卷煙的生產計劃，仍然要通過國家發改委的審批。
“發改委的人說‘只有半個人管你們煙草的事’，我們一個大樓的人還管不好，你們半個人就能管了？”上述煙草專賣局官員笑著說。該煙草專賣局官員建議，類似于發改委這樣的部門，“更重要的還是要把宏觀調控搞好，更好地向市場化進程進一步的推進，這是大部委制應該兼顧的。” 對于大部制改革，這名煙草專賣局官員如此理解：“我覺得現在提出的大部委制和前一階段搞的減少行政審批制，是一種協同推進的過程，而減少行政審批也為大部委制創造了條件。”
承接上述意思，寧夏自治區副主席張來武認為，深化中國的行政體制改革，亟須培育社會中介體系并逐步理清政府、市場和中介組織之間的配置。
“從中國現在的治理結構來看，跟很多發達國家和市場經濟發展比較完善的國家相比，我們政府過強，市場偏弱，中間組織的培育應該加強。”中央黨校經濟學部宏觀室主任梁朋教授回應說。
但與會人士多認為，中間組織的發育在當下中國并非一蹴而就，這涉及到政府從萬能政府向有限政府轉換的一個漫長過程。
張來武用十月懷胎來比喻這個過程的艱辛：中國政府很辛苦，就像一個十月懷胎的婦女，要在肚子里生出一個未來的公民社會，而不能永遠代替你的子女。
“如果政府有這樣的智慧并能把握好節奏，改革將既能解決目前的平穩，又能面對未來的社會的規范。”張來武表示。
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