推進西部地區衛生基礎設施建設的傾斜政策
（一）投入方向重點向西部地區傾斜。
在中央重點支持的項目中，西部地區是建設重點。疾病預防控制體系首先安排建設西部地區的項目，血站建設、農村巡回醫療車配置以及農村衛生服務體系重點建設范圍是中西部地區。正在組織實施的健全基層醫療衛生服務體系建設項目，中央重點支持范圍仍然是中西部地區。
（二）建設資金安排向西部傾斜。
中央安排建設項目的投資中，西部地區平均80％以上為中央資金，如：《農村衛生服務體系建設與發展規劃》中央專項安排169億，中央補助資金比例按東部30％、中部70%、西部80%確定（西藏補助100%）。《國家突發公共衛生事件醫療救治信息系統項目》中央安排1.78億元，中央補助比例為東部50％、中部80％、西部90％。《健全基層醫療衛生服務體系建設方案》縣級醫院建設按照中央對東部、中部、西部地區補助比例20%、55%、70%（西藏補助100%）進行測算，社區衛生服務中心建設項目按照中央對東部、中部、西部地區補助比例為30％、65％、75％測算（西藏補助100%）。
（三）補助額度向西部地區傾斜。
在《農村衛生服務體系建設與發展規劃》中，在測算衛生建設投資時，給予西部地區調增15％補助額度，少數民族自治區再調增10％補助額度（西藏調增15％），西藏、新疆等高寒、邊遠省區再調增10％補助額度（西藏調增15％）測算。
（四）大型醫用設備配置向西部傾斜。
許多西部省份人口少、經濟底子薄，從大型醫用合理配置角度看是不經濟的。但為了充分考慮醫療服務的可及性和公平性，同時更好地滿足西部地區衛生服務的需求，我部在制定甲類大型醫用設備和核準各省上報的乙類規劃時，給予西部地區特殊傾斜。
在中央的大力支持下，通過上述項目的實施，西部地區城市初步形成了社區衛生服務機構與城市醫院相銜接的醫療服務體系，在農村形成了以縣及醫療衛生機構為龍頭、以鄉鎮衛生院為樞紐、以村衛生室為基礎的三級醫療預防保健網。改善了人民群眾健康狀況，在促進地區經濟社會發展方面發揮了重要的保障作用。
西部地區重點地方病防治取得顯著成效
2003年國務院批轉了衛生部、國家發展改革委和財政部制定的《全國重點地方病防治規劃（2004－2010年）》（以下簡稱《規劃》），明確了重點地方病的防治目標，強化了各級政府及有關部門的工作職責，加大對西部地區的資金投入。
2004—2009年，中央轉移支付地方病防治項目安排補助資金16.03億元，用于碘缺乏病、地方性氟中毒、地方性砷中毒、大骨節病和克山病的防治工作，其中西部12個省份安排12.15億元，占地方病防治補助經費總額的75.8%。在中央轉移支付項目中，重點加強了燃煤污染型氟中毒病區改爐改灶工作，共計安排11.63億元用于貧困地區燃煤污染型氟中毒改爐改灶，其中西部省份9.48億元。積極爭取國際組織的支持，2001年—2007年，聯合國兒童基金會項目資助3050萬元，用于新疆、西藏、青海、甘肅等西部省份碘缺乏病綜合干預項目。2008—2009年，中央本級和聯合國兒童基金會共支持615萬元，用于西部省份開展碘缺乏病高危地區重點調查、改善交通工具和辦公條件等。
2007年對《全國重點地方病防治規劃（2004—2010年）》執行情況的中期評估結果顯示，全國已有27個省份實現和基本實現消除碘缺乏病階段目標。2000年基本實現消除階段目標的7個省份（５個為西部省份），除云南省外，其余６個省份實現了消除碘缺乏病階段目標；2000年未實現消除階段目標的7個省份（６個為西部省份），有３個西部省份如期實現了基本消除的階段目標。西部地區8—10歲兒童甲狀腺腫大率由1999年的11.8%下降至2005年的8.0%，居民合格碘鹽食用率由1999年的73.0%上升到2009年的96.4%，除西藏自治區的居民合格碘鹽食用率低于90%以外，其他各省份均在90%以上。
2004年以來，通過中央轉移支付項目，基本查清了全國高氟、高砷水源分布及飲茶型氟中毒的分布范圍；在陜西省和貴州省的燃煤污染型砷中毒病區已全部完成改爐改灶工作。截止2008年，全國燃煤污染型氟中毒改爐改灶率為72%，西部地區已達到69%；2008年，衛生部與貴州省政府簽署了省、部地方性氟中毒合作項目，進一步推進了貴州省地方性氟中毒防治工作。2009年國家將燃煤污染型氟中毒列入重大公共衛生專項，安排改爐改灶87萬戶，屆時全國改爐改灶率將達到83%，西部地區將達到81%；貴州省和陜西省的燃煤污染型地方性砷中毒病區已全部實現了改良爐灶；2007年《全國重點地方病防治規劃（2004—2010年）》中期評估顯示，全國飲水型地方性氟中毒病區村改水率為58%，其中西部地區改水率已達到51%，受益人口由1999年的823萬人上升至2008年的1182萬人。
西部地區根據大骨節病病情，結合退耕還林（牧）、扶貧開發項目和新農村建設等項目，在病區實施了換糧、補硒、改水和異地搬遷等綜合防制措施，西部地區兒童大骨節病X線檢出率由1999年的13.2%下降至2008年的4.5%，大骨節病病情總體上已達到了控制標準。2007年以后，國家投入40多億，用于阿壩州實施扶貧開發和大骨節病綜合防治，這將有效控制當地大骨節病病情，加快當地社會經濟發展。
1999—2008年，在西部地區開展的克山病病情監測工作結果表明，克山病總檢出率在2.8%—5.7%之間。其中，潛在型克山病檢出率波動范圍為2.2%—4.7%；慢型克山病檢出率波動范圍為0.6%—1.0%，克山病病情基本穩定。
加快推進西部地區農村改水改廁和衛生鎮建設
2000—2008年，西部省份農村改廁工作穩步推進。截止2008年底，西部省份農村衛生廁所普及率達到43.98%，較2000年底的31.44%提高12.54個百分點，平均每年增加1.94個百分點。截止2008年底，西部省份累計創建國家衛生鎮（縣城）46個，占全國總數的12%。
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