目前，我國絕大部分醫療機構均為國家所有，多元化投資、多渠道辦醫的格局尚未形成。盡管國家明確鼓勵民營資本進入醫療領域，但由于目前國家對民營醫療機構發展的配套政策和措施還不健全，民營醫療機構難以享有公平的待遇，在很大程度上限制了民營醫療機構的發展。從當前的情況看，民營醫療機構在發展中遇到的困難主要表現在以下幾個方面：
一是民營資本進入困難。各級政府都大力支持民營醫院發展，但由于在土地使用、稅收、準入、人事、社保等方面政策不明確和相互間缺乏有效銜接，以及存在人為設置障礙等原因，民營資本進入醫療市場仍較為困難。
二是民營醫療機構社會認同度低。由于民營醫療機構建立時間短，以及部分民營醫療機構存在的虛假廣告、誘導需求等違規經營現象，使社會對民營醫療機構的總體認同度較低，經營狀況不佳。即使在衛生行業內部，醫護人員也不認同民營醫療機構，難以接受進入民營醫療機構時個人身份的轉變，以及社會和學術地位的降低，因此民營醫療機構引進人才和留住人才較難。
三是民營醫療機構缺乏有效監管。政府加強監管、清除違規行為是扶持民營醫療機構健康發展的重要措施，但目前對民營醫療機構的監管仍有待加強。在絕大多數地區，政府加強了對民營醫療機構的準入管理，但缺乏對其服務質量、服務水平、收費、財務、技術準入和治療結果等的監管，缺乏對機構的合理評估和信息公布。
政策完善的未來取向
“下一步各級政府要本著投入與改革并重的原則，通過進一步完善投入機制，增加政府投入，優化資源配置，推動體制機制創新，實現當前我國醫改的目標。”這位負責人具體解讀說：
其一，科學界定政府與市場的職責邊界，充分發揮政府與市場的作用。總體上說，公共衛生服務屬于典型的公共產品，依靠市場機制難以解決，應通過政府籌資提供。醫療服務屬于準公共產品，既可以由政府直接提供，也可以由市場提供，但政府必須進行嚴格監管。
因此，在社會主義市場經濟體制的框架內，一方面，要強化政府對公共衛生和基本醫療的保障責任，以及對衛生醫療市場的監管責任；另一方面，要充分發揮市場機制的作用，打破政府壟斷局面，鼓勵和支持社會資源投入衛生醫療領域，多渠道壯大衛生醫療資源，滿足人民群眾的多層次醫療需求。具體來講，政府在衛生醫療領域的職責主要包括：
一是實施區域衛生規劃，合理配置資源，制定衛生醫療方面的法律法規，為全體居民提供醫療保障等制度安排，對衛生醫療實行全行業管理；二是組織和提供公共衛生產品，通過疾病預防控制、婦幼保健等公共衛生機構，向社會提供均等化的公共衛生服務；三是組織、支持實施基本醫療保障制度，分散疾病經濟風險，提高基本醫療服務的可及性和公平性；四是對醫療服務市場進行監管，干預醫療服務中的市場失靈和缺陷，規范醫療服務市場和醫療行為，實現醫療服務市場的公平、有序競爭；五是通過政策引導、稅收優惠等方式，積極引導社會資源參與醫療服務市場，鼓勵有利于促進健康和人力資本形成的醫療產品的供給。
當前及今后相當長時期內，應強化政府在建立基本衛生保健制度方面的作用。在公共衛生方面，由政府通過購買服務的方式向居民免費提供服務，所需費用由財政安排；在基本醫療方面，由公立醫療機構或非公立醫療機構提供服務，所需費用按成本收費，通過基本醫療保障體系補償。
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