2009年重點項目優先支持技術領域包括：
（1）重大科技專項相關成果的市場轉化項目：
數控加工技術及其裝備；3G通信系統的配套產品；集成電路設計工具開發；集成電路產品設計開發；系統軟件；提高資源回收利用率的采礦、選礦技術；重污染行業水污染治理技術與設備；新型疫苗；基因工程藥物；中藥創新藥物；化藥創新藥物；心腦血管疾病治療藥物；抗腫瘤藥物；傳染病治療藥物。
（2）促進產業振興的創新項目推廣應用：
汽車零部件前端研發項目；新型動力電池（組）、高性能電池（組）及其相關產品；交通工具輕量化用鋁、鎂、鈦輕合金材料制品及深加工產品；新型纖維材料；紡織及輕工行業專用設備；金屬材料先進制備、加工和成型；數字地面電視；地面無線數字廣播電視；建筑儲能技術及相關產品；水回用工藝技術和設備；科學分析儀器、檢測儀器。
（3）擴大內需、改善民生的關鍵技術及創新產品的推廣應用：
先進的交通管理和控制系統；交通基礎信息采集、處理設備和軟件系統；計算機和終端產品；醫學影像技術產品；介入治療器具材料；面向社區醫療健康的數字化診療集成系統；城市基礎環境保護設施二次污染防治關鍵技術；半導體發光二極管；太陽能。
2009年一般項目優先支持技術領域：
【電子信息領域】
（1）軟件產品
系統軟件；支撐軟件；中間件軟件；嵌入式軟件；計算機輔助工程管理/產品開發軟件；中文及多語種處理軟件；圖形和圖像軟件；金融信息化軟件；地理信息系統；電子商務軟件；電子政務軟件；企業管理軟件。
（2）微電子技術
集成電路設計工具開發；集成電路產品設計開發；集成電路封裝技術；集成電路測試；集成光電子器件。
（3）計算機及網絡產品
計算機和終端產品；各類計算機外圍設備及關鍵部件；網絡產品；空間信息獲取及綜合應用集成系統；面向行業及企業信息化的應用系統；傳感器網絡節點、軟件和系統。
（4）通信產品
光傳輸產品；小型接入設備；無線接入產品；移動通信系統的配套產品；軟交換和VoIP系統；業務運營支撐管理系統；電信網絡增值業務應用系統；3G通信系統的配套產品。
（5）廣播電視技術產品
演播室設備；交互信息處理系統；信息保護系統；數字地面電視；地面無線數字廣播電視；專業音視頻信息處理系統；光發射、接收設備；電臺、電視臺自動化設備；網絡運營綜合管理系統；IPTV設備；高端媒體信息服務平臺；綜合媒體處理系統。
（6）新型電子元器件
半導體發光二極管；片式元件和集成無源元件；片式半導體器件；大功率半導體器件；中高檔機電組件。
（7）信息安全產品
安全測評類產品；安全管理類產品；安全應用類產品；安全基礎類產品；網絡安全類產品；專用安全類產品
（8）智能交通產品
先進的交通管理和控制系統；交通基礎信息采集、處理設備和軟件系統；先進的公共交通管理設備和系統；車載電子設備和系統
【生物、醫藥領域】
（1）醫藥生物技術
新型疫苗；基因工程藥物；重大疾病的基因治療；單克隆抗體及基因工程抗體；核酸類藥物；生物芯片技術及產品；生物技術加工天然藥物；生物分離、裝置、試劑及相關檢測試劑；干細胞技術、RNAi技術、納米技術、模擬多肽、多肽修飾技術及其產品。
（2）中藥、天然藥物
中藥創新藥物；中藥新品種的開發；中藥資源可持續利用；中藥制藥裝備及其集成。
（3）化學藥
化藥創新藥物；心腦血管疾病治療藥物；抗腫瘤藥物；抗感染藥物(包括抗細菌、抗真菌、抗原蟲藥等)；老年病治療藥物；精神神經系統藥物；計劃生育藥物；傳染病治療藥物；治療代謝綜合癥的藥物；罕見病用藥（OrphanDrugs）及診斷用藥；手性藥物；重大工藝創新的藥物及藥物中間體。
（4）新劑型、制劑技術及產品
緩、控釋制劑——固體、液體及復方；靶向給藥系統；新制劑技術；其它新制劑；制劑新輔料。
（5）輕工和化工生物技術
生物催化技術及產品；微生物發酵新技術和新產品；新型、高效工業酶制劑；天然產物有效成份的分離提取技術；生物技術在食品安全領域的應用。
【新材料領域】
（1）金屬材料
交通工具輕量化用鋁、鎂、鈦輕合金材料制品及深加工產品；應用于輕工、石化、紡織等行業的高性能金屬材料；特殊性能合金及粉末冶金新材料；低成本、高性能金屬復合材料
；電子元器件用金屬功能材料；超導材料；特殊功能有色金屬材料及應用制品；高性能稀土功能材料及其應用；半導體材料；金屬材料先進制備、加工和成型。
（2）無機非金屬材料
高性能結構陶瓷；高性能功能陶瓷；人工晶體；功能玻璃；節能與環保用新型無機非金屬材料及工藝設備；超細、納米粉體制備、成型及加工。
（3）高分子材料
高性能高分子結構材料；新型高分子功能材料；高分子材料的低成本化和高性能化；新型橡膠材料；新型纖維材料；生物基材料及降解產品；高分子材料的加工應用技術。
（4）生物醫用材料
介入治療器具材料；心腦血管外科用新型生物材料及產品；骨科內植物；口腔材料；組織工程用材料及產品；新型敷料及止血材料；專用手術器械及材料；其它生物醫用材料。
（5）精細化學品
電子化學品；新型催化劑；新型橡塑助劑；超細功能材料；其它精細及功能化學品；非石油路線制備大宗化學品。
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