資金有限也讓一些無人島的開發難以為繼，有投資者租下無人島后無力進行綜合開發。無人島面向社會公眾開發后，管理難度也隨之增大。讓環保部門、旅游部門、漁政部門一個一個島去實地管理監督，顯然是不現實的。這就帶來許多隱患。
無人島開發除了一些大手筆的投資外，一些無水、無電、面積較小的無人島沒有人問津。而已經開發的無人島有的由于資金短缺，規劃的項目成了“爛尾樓”，還有的多家開發，造成惡性競爭。導致開發層次不高，利用效率低下。
并且，目前的海島開發大多局限于單項開發，一島一用，或用于放牧，或用于涂養，或用于采石，或作為航標燈塔基地等。缺少嚴格保護資源與生態環境的必要手段和措施。
目前最令人擔憂的是，關于無居民海島的管理，目前國家和省區層面還沒有相關法律法規的規定。《海島法》將是一部解決這個問題的法律，但至今仍然沒有出臺。
正因為沒有法律的約束，對于開發利用無人島的管理一直都存在著混亂。以浙江為例，無人島的使用權和承包權，不僅各市縣政府有審批權利，就連鄉政府都有審批權，存在著隨意審批、無序開發的情況，沒有統一的規劃。方康保說：“特別是這幾年的開發無人島熱潮，由于上面沒有規定，下面想怎么開發就怎么開發，非常混亂，所以我們暫停了市、縣的審批權利，開始做省內開發利用無人島的摸底調查。”
溫州海洋與漁業局海域管理處的一位不愿透露姓名的工作人員告訴《北京科技報》，溫州目前還沒有開始預申請，只是有這方面的意向，正在做無人島合理開發利用這方面的規劃。
目前溫州海洋與漁業局對無人島使用費的評估還正在進行，不同的地理位置，自然、人文資源，是否容易遭到臺風襲擊等都會作為評估其使用費的要素之一。而且將來即便有人能夠成為“島主”，也不具有小島的產權，擁有的只是土地使用權及一些建筑設施的產權，還得遵守無人島開發利用的一些禁令。
展望開發無人島的未來，方康保說，旅游天堂馬爾代夫的經驗值得我們借鑒。
馬爾代夫是印度洋上的群島國家，由19組珊瑚環礁、1200多個珊瑚島嶼組成，其中202個島嶼有人居住。當地的海島開發均由一個經濟主體向政府租賃一個海島及周邊海域，以一座海島建設一個酒店，建成一個完整、獨立、封閉式度假村的模式經營發展。正是這種一島一店的“小、清、靜”的開發模式使馬爾代夫海島開發取得了極大的成功，濱海旅游獨領風騷，被稱為海島開發的“馬爾代夫模式”。
馬爾代夫旅游部門的主要職責是代表國家對外出租海島、組織審查海島開發規劃和各開發海島的建設布局、制定濱海旅游法規規范，以及旅游業的日常監督管理。為此馬爾代夫成立了由旅游、漁業、交通等部門組成的國家旅游委員會，及時解決旅游發展中遇到的問題，并協同制定相關法律規范等。
同時，政府對海島開發實行嚴格的審查批準制度，海島上所有建筑都必須經旅游部門批準才能建設，并明確規定海島建筑面積不能超過海島總面積的20%。
而號稱南太平洋“十字路口”的島國斐濟，也將無人島面向世界尋找投資者。斐濟由332個島嶼組成，其中106個島有人居住。
據太平洋島國論壇秘書處投資經理袁光明介紹，這些海島價格不菲，斐濟一塊面積大約1平方公里的海島，現在標價已經高達2000萬斐濟元，約合人民幣8000萬元。相當于每平方米80元。當然這塊地基礎設施十分完善，水、電等配套設施齊全，如果是購買邊遠地區，尚未有人進去過的荒蕪海島，價格會便宜很多。
浙江省對于無人島的開發還是比較慎重的，已經開始在做無居民海島保護與利用的規劃。想做“島主”現在也有一個過渡性的辦法，要開發利用海島，必須是具有一定規模，能夠推動當地經濟發展的項目，或者是省級重點項目才有可能批復。批復之前還要通過省無居民海島管理聯席會議審核同意，報省政府批準才可開展。
方康保說，“島嶼的承載能力是很有限的，生態環境也相對脆弱。如果無序開發，不注重保護，只會破壞這些珍貴的島嶼資源。等摸底調查做完，我們將來就可以對無人島做一些適度的開發利用。”（來源：北青網-北京科技報）
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