2008年，全海域共發生赤潮68次，累計面積13 738平方公里，與上年相比，赤潮發生次數減少14次，赤潮累計面積增加2 128平方公里。其中，渤海1次，面積30平方公里；黃海12次，累計面積1 578平方公里；東海47次，累計面積12 070平方公里；南海8次，累計面積60平方公里。東海仍為我國赤潮的高發區，其赤潮發生次數和累計面積分別占全海域的69%和88%。
2008年，全海域共發生500平方公里以上的大面積和較大面積赤潮9次，大多數集中在浙江近岸、近海和長江口外海域，累計面積9 750平方公里，占全海域累計面積的71%。
2003～2008年各海區赤潮發生次數和累計面積
2008年我國海域發生的較大規模赤潮
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起止時間
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地 點
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面 積
(平方公里)
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主要赤潮生物種類
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5月3日~4日
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浙江漁山列島以北附近海域
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1 150
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具齒原甲藻
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5月5日~8日
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浙江東福山至漁山列島海域
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2 100
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具齒原甲藻、輪狀斯克藻
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5月16日~24日
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浙江朱家尖-中街山列島-花鳥山附近海域
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2 600
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具齒原甲藻
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5月20日
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浙江中南部海域，大陳島西側-漁山列島-韭山列島南部
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900
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—
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5月23日~24日
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浙江寧波油菜嶼以東海域
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500
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具齒原甲藻、尖刺菱形藻
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6月2日~6日
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舟山北部至花鳥山海域
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800
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具齒原甲藻
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6月16日～21日
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遼寧丹東附近海域
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500
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夜光藻
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8月12日～13日
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江蘇南通外海海域
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600
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—
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9月24日
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長江口外海域
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600
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中肋骨條藻、紅色中縊蟲
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合 計
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9 750
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注：“ — ”表示未檢測。
2008年，引發我國海域赤潮的優勢生物種類主要為無毒性的具齒原甲藻（東海原甲藻）、中肋骨條藻、夜光藻和對養殖生物有毒害作用的米氏凱倫藻、血紅哈卡藻、卡盾藻等，一些赤潮由兩種或兩種以上生物共同引發。其中，具齒原甲藻作為第一優勢種引發的赤潮22次，累計面積8 330平方公里；由中肋骨條藻作為第一優勢種引發的赤潮10次，累計面積1 372平方公里；由夜光藻作為第一優勢種引發的赤潮5次，累計面積695平方公里。這三種優勢種引發的赤潮分別占赤潮總次數的54.4%和累計面積的75.7%。
有毒、有害赤潮生物引發的赤潮11次，累計面積約610平方公里，分別占赤潮發生次數和累計面積的16%和4%，比上年度分別減少15%和12%。
渤海 發生赤潮1次，面積30平方公里，是近年來赤潮發生次數和面積最少的一年。
黃海 發生赤潮12次，累計面積1 578平方公里，比上年赤潮發生次數增加7次，累計面積增加832平方公里。赤潮較集中發生在8月和6月；并且首次于2月在大連灣記錄到赤潮，面積近110平方公里。
東海 發生赤潮47次，累計面積12 070平方公里。與上年相比，赤潮發生次數減少13次；累計面積增加2 283平方公里。赤潮集中發生在5月份。
南海 發生赤潮8次，累計面積60平方公里；赤潮較集中發生在2月、3月和11月，但每次赤潮面積都相對較小。與上年相比，赤潮發生次數減少2次，累計面積減少436平方公里。
