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國際微生物大數(shù)據(jù)平臺的應(yīng)用與啟示

發(fā)布時間:2018-09-07 11:49:46  |  來源:中國網(wǎng)·中國發(fā)展門戶網(wǎng)  |  作者:劉柳 馬俊才  |  責任編輯:趙斌宇
關(guān)鍵詞:微生物資源,微生物大數(shù)據(jù),大數(shù)據(jù)平臺,戰(zhàn)略資源

全面參與國際微生物數(shù)據(jù)標準制定

長期以來,由于各個微生物資源中心采用不同的數(shù)據(jù)格式進行數(shù)據(jù)管理和共享,這極大地阻礙了微生物數(shù)據(jù)交換和在全球范圍共享資源的效率。中國科學(xué)院微生物研究所微生物資源與大數(shù)據(jù)中心和?WDCM?基于其組織的全球微生物菌種目錄(GCM)微生物數(shù)據(jù)資源國際合作計劃的工作基礎(chǔ),并經(jīng)過與國際標準化組織生物技術(shù)委員會(ISO/TC 276)及?WDCM?各國專家的討論逐漸形成了《微生物資源中心數(shù)據(jù)管理和數(shù)據(jù)發(fā)布標準(草案)》。經(jīng)過一年多的籌備,2017?年?7?月,作為?ISO/TC276?生物樣本庫與生物資源工作組(WG2)和生物數(shù)據(jù)處理及整合工作組(WG5)的共同項目,該項目通過了?ISO?的新工作項目提案(new work item proposal)投票正式立項。該項目現(xiàn)已注冊為工作草案(working draft),預(yù)計將在?2?年內(nèi)正式發(fā)布國際標準,并將成為微生物資源數(shù)據(jù)領(lǐng)域的第一個?ISO?國際標準。該標準的制定和實施將有助于保證微生物資源數(shù)據(jù)質(zhì)量,并提高全球范圍微生物數(shù)據(jù)的兼容性和互操作性,為高效的數(shù)據(jù)共享和大數(shù)據(jù)分析提供基礎(chǔ)。

為《名古屋議定書》及履約工作在微生物領(lǐng)域的實施提供重要支撐

我國幅員遼闊,是全球?12?個生物多樣性大國之一,遺傳資源極其豐富。但長期以來,我國一直是發(fā)達國家獲取遺傳資源和遺傳資源相關(guān)傳統(tǒng)知識的主要對象,外國機構(gòu)和個人通過多種非正當手段大量獲取我國豐富的生物遺傳資源,由此造成的流失數(shù)量和價值難以估量,形勢十分嚴峻。

《生物多樣性公約》(Convention on Biological Diversity,CBD)旨在保護瀕臨滅絕的植物和動物,最大限度地保護地球上的多種多樣的生物資源,以造福于當代和子孫后代。我國于?1992?年?6?月11日簽署該公約,1992?年11月7日批準,1993?年1月5日交存加入書。2010年10月,聯(lián)合國《生物多樣性條約》第?10?屆締約方大會(簡稱“COP10”)通過《名古屋議定書》(The Nagoya Protocol,NP);2014?年10月,《名古屋議定書》正式生效。《名古屋議定書》規(guī)定通過適當?shù)馁Y金援助和技術(shù)合作來保護生物多樣性,實現(xiàn)生物遺傳資源的可持續(xù)利用,其目的在于保障生物遺傳資源利益的公平分配。

WDCM?大數(shù)據(jù)平臺下的“全球微生物菌種目錄系統(tǒng)”(GCM)是一個包含微生物資源的檢索、分析和可視化的綜合數(shù)據(jù)庫。GCM?結(jié)合更多的在線目錄數(shù)據(jù),將菌種資源與核酸序列、蛋白質(zhì)、參考文獻、引文數(shù)據(jù)等進行關(guān)聯(lián),并以統(tǒng)一數(shù)據(jù)門戶的形式,對全世界科技界和產(chǎn)業(yè)界提供微生物菌種資源的信息服務(wù)。GCM?對于微生物實物資源從采集、保藏、跨國轉(zhuǎn)移、學(xué)術(shù)和商業(yè)應(yīng)用以及利益分享的各個環(huán)節(jié)都能提供有效的數(shù)據(jù)支持,為《生物多樣性公約》及《名古屋議定書》(CBD/NP)在微生物領(lǐng)域的實施和執(zhí)行提供最重要的支撐。GCM?平臺及其相關(guān)的指導(dǎo)原則,在國際上第一次建成一套完善的可運行的信息平臺方案。WDCM?在?CBD/NP?實施方面的相關(guān)工作,也符合我國參與?CBD?工作的主要方向。目前,CBD?的信息交換所、國際微生物領(lǐng)域、法律界以及我國環(huán)保部專家都對?WDCM?的相關(guān)工作給予了高度認可,對?GCM?平臺對?CBD/NP?的實施給予了相當?shù)目隙ā?/p>

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