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國際微生物大數據平臺的應用與啟示

發布時間:2018-09-07 11:49:46  |  來源:中國網·中國發展門戶網  |  作者:劉柳 馬俊才  |  責任編輯:趙斌宇
關鍵詞:微生物資源,微生物大數據,大數據平臺,戰略資源

全面參與國際微生物數據標準制定

長期以來,由于各個微生物資源中心采用不同的數據格式進行數據管理和共享,這極大地阻礙了微生物數據交換和在全球范圍共享資源的效率。中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心和?WDCM?基于其組織的全球微生物菌種目錄(GCM)微生物數據資源國際合作計劃的工作基礎,并經過與國際標準化組織生物技術委員會(ISO/TC 276)及?WDCM?各國專家的討論逐漸形成了《微生物資源中心數據管理和數據發布標準(草案)》。經過一年多的籌備,2017?年?7?月,作為?ISO/TC276?生物樣本庫與生物資源工作組(WG2)和生物數據處理及整合工作組(WG5)的共同項目,該項目通過了?ISO?的新工作項目提案(new work item proposal)投票正式立項。該項目現已注冊為工作草案(working draft),預計將在?2?年內正式發布國際標準,并將成為微生物資源數據領域的第一個?ISO?國際標準。該標準的制定和實施將有助于保證微生物資源數據質量,并提高全球范圍微生物數據的兼容性和互操作性,為高效的數據共享和大數據分析提供基礎。

為《名古屋議定書》及履約工作在微生物領域的實施提供重要支撐

我國幅員遼闊,是全球?12?個生物多樣性大國之一,遺傳資源極其豐富。但長期以來,我國一直是發達國家獲取遺傳資源和遺傳資源相關傳統知識的主要對象,外國機構和個人通過多種非正當手段大量獲取我國豐富的生物遺傳資源,由此造成的流失數量和價值難以估量,形勢十分嚴峻。

《生物多樣性公約》(Convention on Biological Diversity,CBD)旨在保護瀕臨滅絕的植物和動物,最大限度地保護地球上的多種多樣的生物資源,以造福于當代和子孫后代。我國于?1992?年?6?月11日簽署該公約,1992?年11月7日批準,1993?年1月5日交存加入書。2010年10月,聯合國《生物多樣性條約》第?10?屆締約方大會(簡稱“COP10”)通過《名古屋議定書》(The Nagoya Protocol,NP);2014?年10月,《名古屋議定書》正式生效。《名古屋議定書》規定通過適當的資金援助和技術合作來保護生物多樣性,實現生物遺傳資源的可持續利用,其目的在于保障生物遺傳資源利益的公平分配。

WDCM?大數據平臺下的“全球微生物菌種目錄系統”(GCM)是一個包含微生物資源的檢索、分析和可視化的綜合數據庫。GCM?結合更多的在線目錄數據,將菌種資源與核酸序列、蛋白質、參考文獻、引文數據等進行關聯,并以統一數據門戶的形式,對全世界科技界和產業界提供微生物菌種資源的信息服務。GCM?對于微生物實物資源從采集、保藏、跨國轉移、學術和商業應用以及利益分享的各個環節都能提供有效的數據支持,為《生物多樣性公約》及《名古屋議定書》(CBD/NP)在微生物領域的實施和執行提供最重要的支撐。GCM?平臺及其相關的指導原則,在國際上第一次建成一套完善的可運行的信息平臺方案。WDCM?在?CBD/NP?實施方面的相關工作,也符合我國參與?CBD?工作的主要方向。目前,CBD?的信息交換所、國際微生物領域、法律界以及我國環保部專家都對?WDCM?的相關工作給予了高度認可,對?GCM?平臺對?CBD/NP?的實施給予了相當的肯定。

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