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國際微生物大數據平臺的應用與啟示

發布時間:2018-09-07 11:49:46  |  來源:中國網·中國發展門戶網  |  作者:劉柳 馬俊才  |  責任編輯:趙斌宇
關鍵詞:微生物資源,微生物大數據,大數據平臺,戰略資源

 

中國網/中國發展門戶網訊  微生物資源是人類賴以生存和發展的重要物質基礎,是生命科學和生物技術創新的重要源泉。隨著生物大數據時代的到來,微生物及其基因資源數據也正呈現爆炸性增長,微生物學研究正從以數據為支撐逐漸向以數據為中心轉變,海量數據的整理整合和開放共享對于微生物資源的研究和利用變得至關重要,微生物學已進入了組學數據時代。

與微生物相關的數據資源建設方面,國內許多單位已經分別建立了近百個生物信息資源數據庫,數據總量達到?PB?量級。在國家“863”計劃的支持下,我國生物信息技術與平臺管理技術體系已經成熟。北京和上海建立了分布式的生命科學基礎公共信息分享平臺,為國際公共數據庫的引進、我國生物學基礎科學數據的共享、二次數據庫的開發做了大量卓有成效的工作,使我國在分布式的生命科學基礎公共信息分享平臺建設奠定了良好基礎。

在大數據的背景下,未來的微生物學研究必將朝著形成一個全方位的微生物資源研究、開發與應用的網絡的方向發展,微生物研究各個環節的聯系更加緊密,但每個環節的深度也在不斷增加,對數據應用必將提出更高的要求。隨著云技術的發展,為大規模的數據存儲、計算和多樣化的分析提供了很好的解決方案。因此,利用云技術,為科學家提供既包括整合型的數據,又能夠提供可定制數據分析服務的平臺,也將是未來微生物學數據研究的一個重要趨勢。

微生物資源與微生物大數據是國家重要戰略資源

微生物作為最簡單的生命體,蘊藏著極為豐富的物種資源和基因資源,微生物豐富的生物多樣性也使其成為生物技術和生物產業發展的基石,為人類解決能源、環境危機提供了重要平臺。目前可培養微生物僅占微生物資源的?1%,而且這些已培養的微生物菌種的利用程度也非常低;因此,微生物資源是一筆巨大的、尚未開發的資源財富,開發和利用微生物資源具有重要的現實意義。微生物資源的有效利用是國民經濟可持續發展不可或缺的條件之一,直接影響國家的未來經濟發展潛力,也是一個國家重要的戰略資源。美國、歐盟、日本等都將微生物資源的開發與利用納入其戰略發展規劃,并圍繞微生物資源的發掘利用和產業開發等主題進行了中長期的部署。

微生物數據資源是微生物資源共享和開發的關鍵環節,數據資源的豐富性、準確性和共享水平決定著整個微生物學領域研究和應用的綜合能力。與實物資源相比,微生物數據資源是最有可能實現共享的一種資源。通過信息技術,建立統一的數據標準,為微生物資源研究的各個環節提供包括數據管理及共享、數據分析、計算模型等在內的支撐,促進信息資源的共享從而帶動微生物資源的開發和利用,對微生物資源研究和生物技術發展具有重要意義。21?世紀初,國際經濟合作與發展組織(OECD)推動建設全球生物資源中心網絡(Global Biological Resources Centre Network,GBRCN),歐盟也推動過歐洲生物資源及信息共享項目(Common Access to Biological Resources and Information,CABRI),但是這些計劃由于缺乏共享機制和技術力量支持等原因,都沒能建立一個穩定運行的、成熟的國際性數據平臺。

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