2009年2月18日，中國校友會網、《大學》雜志和21世紀人才報等機構發布《2009中國大學評價研究報告》。北京大學連續兩年問鼎2009中國大學排行榜榜首，清華大學居第二，復旦大學名列第三，浙江大學和南京大學分列第四和第五。江西藍天學院連續三年蟬聯2009中國民辦大學排行榜榜首，湖南涉外經濟學院居第二，黃河科技學院列第三。華中科技大學武昌分校居2009中國獨立學院排行榜第一名，浙江大學寧波理工學院和武漢科技大學中南分校分列第二和第三。其中，2008年北京大學媒體曝光率全國最高，有243000篇，清華大學緊隨其后，有201000篇新聞報道，位居第二，中國人民大學緊隨其后列第三。
中國校友會網大學評價課題組已連續7年開展的大學評價研究工作，在我國高等教育領域有著廣泛的影響力，已成為考生及家長高考填報志愿的重要參考，是我國民間最具影響力的大學排行榜之一。課題組首席專家、中南大學蔡言厚教授介紹說，我們的評價是以“衡量高校對科學與人才的貢獻能力”為標準，是對高校的歷史和現時結合的“選優排序”，而不只是現時的“綜合排序”，更不是“規模排序”，體現的是高校的歷史成就、現時能力和辦學特色等狀況，指標數據基本采用截至2008年各高校的最新數據。
大學校長要保持清醒頭腦，要立足長遠、找準辦學定位、發展自身優勢
自1987年起我國開展大學評價至今已經有20多年的歷史，但關于中國大學排行榜的爭議和質疑從未中斷過。中南大學蔡言厚教授分析說，原因在于目前大學評價存在諸多問題，其一，評價指標照搬國外做法,不符合我國國情。其二，“科學研究評價”重數量，輕質量，且重理輕文。其三，“人才培養評價”只看學生數量不看質量；重“進口”，輕“出口”，只看重學生入學分數和畢業生學歷，忽視畢業生發展能力。其四，評價只看大學“現時狀況”，忽視高校“歷史成就”；其五，評價觀念嚴重落后于時代發展，評價結果以偏概全，故弄玄虛等等。可以說存在這些的問題大學評價已成為目前我國大學急功近利、重科研、輕教學、盲目擴招和學術造假事件頻出等問題出現的催化劑。
為此，蔡言厚教授建議，大學校長要保持清醒的頭腦，要了解自身優勢和弱勢，不能急功近利，應立足長遠，找準辦學定位，發展自身優勢，不要被一些排行榜所迷惑。大學評價者的評價觀念要跟得上時代的發展步伐，應敞開心懷虛心接受來自社會和高校的意見和建議，應有勇氣修正已經過時和不符合時代要求的指標，凡是涌現出的能比較持續地反映高校的質量指標都應成為評價大學的依據。評價指標數據應采用獨立的第三方評估結果，大學評價者不能采用自身認定指標數據，否則很難保證評價結果客觀公正。
報告發布2009中國大學排行榜800強，北大、清華和復旦蟬聯前三甲
《2009中國大學評價研究報告》對我國800多所公辦高校和民辦高校(含獨立學院)展開綜合評價，并公布2009中國大學排行榜800強等榜單，還發布體現我國高校辦學優勢與特色的中國高校杰出校友排行榜、中國高校科學貢獻力排行榜和中國最受媒體關注大學排行榜等榜。其中北京大學蟬聯“2009中國大學排行榜”榜首，清華大學居第二；復旦大學名列第三，浙江大學居第四；南京大學列第五，上海交通大學列第六，武漢大學列第七；中國人民大學上升至第八，吉林大學列第九，四川大學居第十，前10名與上年相比沒有發生變化，只是中國人民大學與吉林大學換了位置。
位居2009中國大學排行榜第十一至二十名高校依次是華中科技大學、中山大學、南開大學、北京師范大學、山東大學、中國科技大學、哈爾濱工業大學、中南大學、西安交通大學和廈門大學。
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