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世界首個普通野生稻全基因組框架圖譜繪制完成

2010年09月03日16:54 | 中國發展門戶網 www.chinagate.cn | 給編輯寫信 字號:T|T
關鍵詞: 野生稻 基因組 基因 粳稻

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中科院昆明植物研究所研究員高立志及團隊宣布,運用新一代高通量測序技術以及基于高性能超算的生物信息學分析,日前已完成普通野生稻基因組高覆蓋的序列測定、拼接和組裝工作,獲得了普通野生稻全基因組從頭測序的框架圖,基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖譜標準。這是我國科學家自主完成的第一個野生稻全基因組測序計劃,也是世界首個高雜合度野生稻全基因組框架圖譜。

中國是亞洲栽培稻的起源地之一,水稻是中國第一大糧食作物,養活了80%以上的中國人口。普通野生稻是亞洲栽培稻的公認祖先種,被列為國家二級保護植物,蘊藏著許多尚未認識與利用的優異基因。由于它與栽培稻有著密切的親緣關系,迄今水稻常規育種取得的大多數突破無不與發掘利用該種野生稻的優異基因相關。例如,袁隆平等利用海南島的一株雄性不育普通野生稻(野敗)中的細胞質雄性不育基因,育成了聞名中外的雜交水稻。

此前,粳稻(日本晴)基因組的精細圖譜已經獲得,秈稻(9311)基因組的框架圖譜也由我國科學家完成。現在普通野生稻全基因組框架圖譜的獲得以及精細圖譜的進一步繪制,不僅大大地促進水稻重要功能基因的規模化解析與鑒定,為進一步發掘利用普通野生稻豐富的優異基因資源提供了前所未有的機遇。

本項目的完成主要依托于2009年年底順利通過國家驗收的國家大科學工程中國西南野生生物種質資源庫先進的基因組學與生物信息學平臺。測序結果已覆蓋92%的普通野生稻全基因組,基因覆蓋度約為90%以上。目前,項目組正在加緊繪制普通野生稻的基因組精細圖譜。

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