6月19日，一份《中國青少年發展基金會等5家基金會就2008年度企業所得稅匯算清繳延期進行的緊急請示》【中青基聯（2009）1號】（以下簡稱《請示》），傳真到《每日經濟新聞》編輯部。
針對國家稅務總局近期向基金會組織征收企業所得稅的問題，包括中國青基會、中國扶貧基金會等在內的5家基金會聯名上書，提出反對意見。
基金會
稅金先繳后退或致捐贈人誤解
上述《請示》直指近來頗受爭議的基金會組織的“捐贈收入”是否應計入企業所得稅的問題。
《請示》稱：“近期，稅務局各分管所正在進行2008年度企業所得稅匯算清繳工作，要求我們5家基金會把捐贈收入并入應稅所得計繳2008年度企業所得稅，待非營利的資格認定下來以后再將相應稅款予以返還。我們共同認為，此舉是不妥的，如此操作將產生嚴重不良后果。”5家冠名基金會是：中國青少年發展基金會、中國扶貧基金會、中國兒童少年基金會、南都公益基金會和友成企業家扶貧基金會。
《每日經濟新聞》報隨即獨家專訪了中國青少年發展基金會秘書長涂猛。涂猛稱：“按照相關法律規定，基金會所募集的資金不應繳稅，因此有關部門向我們收稅有違規之嫌。中國青少年基金會在2008年募集資金4億元，除去5·12汶川賑災等項目支出2億，還剩2億。國家稅務總局按照（總收入－資助支出）×20%的企業所得稅計算辦法，要從基金會收走4000萬元的企業所得稅。”
據涂猛介紹，國家稅務總局已分別通知了前述5家基金會，準備收取企業所得稅。該5家基金會表示反對，并集體匯成《請示》書面材料，遞交到財政部、國家稅務總局和民政部，但尚未得到答復。
涂猛說，對于基金會組織而言，先繳稅后退稅是從來沒有過的事。更為嚴重的是，此舉將給基金會帶來資助資金撥付的困難，給捐贈人乃至社會帶來誤解。
南都基金會秘書長徐永光在接受《每日經濟新聞》專訪時說，自2008年新《企業所得稅法》實施以后，至今一年半過去了，所有的基金會（稅前扣除）資格認定都沒有得到核準。“這樣對基金會的稅收就要形成一筆糊涂賬。”徐永光對此憂心忡忡。
據徐永光介紹，發達國家對基金會接受的捐款免予征稅，捐贈資金形成的投資增值收入也免稅；至于企業或私人給基金會的捐款，用基金會所開的發票可以抵稅。而2008年南都集團給南都基金會捐贈了6400萬現金，用于賑災5·12汶川大地震項目，但基金會給南都集團開出的發票卻失去作用，南都集團享受不到12%的抵稅優惠政策。
國稅總局
征稅是臨時措施
《每日經濟新聞》記者試圖從國家稅務總局得到相關的解釋，但所得稅司綜合處的官員說，對基金會（稅前扣除）資格認定方案還沒出來以前，上述基金會組織需要繳稅。不過“這是臨時措施，具體問題不能說”。
此外，國家稅務總局相關負責人還表示，南都基金會不是資格認定單位。對此涂猛認為，中國青少年發展基金會與其他4家單位都是在民政部注冊的國家級基金會，完全符合《基金會管理辦法》的9條規定。徐永光也表示，南都基金會符合相關規定。
對于基金會組織的意見，民政部基金會管理處處長劉忠祥在接受《每日經濟新聞》專訪時說，對5家基金會捐贈收入是否課稅，解釋權在國家稅務總局和財政部。
劉忠祥說，按照《基金會管理辦法》條例規定，基金會早先享受兩塊優惠政策：一是捐贈收入，一是存款利息，均不收所得稅。
但自2008年1月1日新《企業所得稅法》出臺以后，財政部發文規定，基金會原來所享受的優惠政策暫時停止、取消，同時等待新的政策出臺。但直到目前，新的政策還沒有出臺，一些稅務部門也開始向基金會征收相應稅賦。
華夏文化紐帶工程組委會執行委員會常委、中華社會文化發展基金會副秘書長蔣曄在接受《每日經濟新聞》采訪時表示，2008年中國基金會行業發生了歷史以來第一次 “井噴”現象，整個基金會行業募集資金1050億元。蔣曄還認為，以基金會法人資質認定方案沒有出臺作為征稅的理由之一，這一做法值得商榷。
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