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2008年，中國博士學位授予數量超過了美國，成為世界上最大的博士學位授予國家。2009年，全國在讀博士生達到24.63萬人；2010年，全國博士招生計劃為6.2萬人。
招收學生的依據是導師個人偏好，別人無權干涉。在博士招生規模很小、導師選拔嚴格的條件下，這種方式與博士培養的要求是相匹配的。但隨著中國博士教育規模急劇擴大，招生腐敗亦隨之出現。
在美國讀博士，課程學習是最重要的一部分，每一門課程幾乎都要求達到世界最前沿水平，每門課程都需要通過嚴格的考試。而對博士生的評估，則是由第三方的中介機構進行。也就是說，決定一名博士生能否畢業，該名博士生的導師說了不算，而是由導師指導委員會進行決定。
但在中國，博士的課程學習幾乎淪為了擺設。在這次調查中，幾名博士生導師都表示，“給博士生上課是沒有必要的。”有些導師甚至直言，“即使一門課都沒有，我也沒什么意見。學生培養計劃發放下來的時候，我就非常不認真，簽個字就算了。學生要上哪幾門課，可以去問師兄。關鍵是學分夠了就行了，他們上幾門課我也不知道。”
于是，學術研究便成為中國博士們最重要的學習方式。
陳洪捷表示，導師普遍的想法是，“活是肯定要干的，因為研究訓練肯定要在實踐中去完成。”但是，研究項目本身的科研含量有多少，是問題的關鍵。
而學生則稱，“我做了很多項目，出了很多差，但是回過頭來看，這和工作有什么區別啊？讀博期間還做那么多橫向項目，還不如出去工作。”
橫向項目一般是指來自市場的項目，多見于理工科，一般是將已有的理論成果轉化到實際應用中去，因此產品直接與市場有關。在中國教育“產學研”一體化后，橫向項目便成為課題組的重要經費來源。
與橫向項目相對應的是縱向項目，一般是指來自中國教育系統內部層層下達的科研任務。縱向課題多是理論研究，需要的是學術創新成果。由于中國的科研經費僧多粥少，縱向課題的經費，往往只包括購買儀器、設備、資料和差旅費，不允許用于人才培養。
因此有學生稱，在一些項目中，“有些老師自己一年拿幾十萬，對一個學生一兩萬都不愿支付。”
于是，師生關系演變為一種類于雇傭的關系。2006年，上海某高校就曾發生過幾位研究生不滿導師“剝削”而集體將其“炒掉”的事件。更有甚者，有的導師讓研究生幫其著書，自己卻不進行任何指導或把關。學生為了表示“無聲的抗議”，竟連篇累牘地抄襲別人的著作，引發官司，讓導師的丑聞最終曝光。這些看似荒唐的現象，在赤裸裸的“員工”與“老板”的關系中是不足為怪的。
“中國培養博士的一個傳統概念就是，你的導師是誰，他就成為你唯一的指導人。他給你項目，給你錢，這就牽扯到利益關系。” 陳洪捷說。
這樣一來，博士生和導師之間，就像一個小公司中老板和員工的關系。
一些博士生導師辯解稱，他們會安排博士生做科研項目中需要思考和技術創新的部分，而那些純粹的基礎工作，則交給碩士生去做。但在實際操作中，這兩種任務其實很難區分。
為了整治招生腐敗，中國高校開始更多地借鑒美國經驗，實行越來越嚴格的量化管理。但博士培養制度依然還是過去的學徒式，這也就使得美國的老板制在中國被異化。
《中國博士質量調查》書中說，“全國指導博士生在20人以上的導師不在少數，指導博士生最多的一位導師手頭上有110多位博士生，但是，許多博士生從入學到畢業沒有見過導師一面。”
陳洪捷認為，這種情況雖然存在，但并沒有上述所言如此嚴重。但他也指出，“這不是某個導師的問題，而是整個科研體制的問題。”