《意見》爭議焦點：
臨近出臺稅收問題仍有爭議
記者了解到，在李克強副總理過問《意見》進展之后，在一些問題上各部門就各自的不同看法進一步溝通和磋商。
今年2月16日，國家發改委向國務院提交了對《意見》(代擬稿)的意見，各部門對《意見》(代擬稿)的內容已經“基本達成一致意見”。
但在從事國際航運船舶涉及關稅、增值稅和出口退稅問題上，各方仍未達成一致。如上海市、交通運輸部明確表示了應該給予支持的態度，稅務部門認為可以采取稅收減免，但也有部門表示反對。
事實上，在“兩個中心”稅收制度上的松動被不少學者視為《意見》的實質性內容。去年9月3日，上海國際航運中心上海地區領導小組辦公室主任許培星在接受《中國經濟周刊》采訪時曾向記者坦言，“擴展洋山保稅港區相關功能需要在該份《意見》中獲得體現。”
而周振華認為，發展金融、航運這樣的現代服務業與傳統工業發展模式有所不同，應該突出人力資本、品牌、渠道的價值。目前國內的個人所得稅法所規定的稅率，遠遠高于國際金融中心爭奪者的香港和新加坡。
事實上，《意見》的細則已經明確提出，(在上海)基本形成符合發展需要和國際慣例的稅收、信用和監管等法律法規，以及具有國際競爭力的金融發展環境。
《意見》真正落實：
試水意義 “以改革建制度”
分析人士告訴《中國經濟周刊》，為了使《意見》更好落實，應該考慮到建立協調機制。
根據上海市新聞辦公室提供給媒體的公開資料顯示，國家有關部門將建立必要的協調機制，來研究解決推進上海國際金融中心建設過程中的新情況和新問題，提出解決辦法。不過，單單依靠“協調推進機制”似乎很難解決上海在落實建設“兩個中心”這一國家戰略中的所有問題。
在采訪中，不少上海市政府智囊和學者告訴《中國經濟周刊》這樣一個觀點，《意見》之所以把“改革促發展，以改革解難題，以改革建制度”看得如此重要，或許在國務院領導看來只有完善的現代企業制度、高效的行政體制、廉潔的公務人員，才是落實中央部署的真正保證。
“堅持以改革促發展，以改革解難題，以改革建制度。推進企業改革和改組，特別要加快政府職能轉變和管理創新，為經濟和社會發展營造良好環境。”這一提法被寫入《意見》，意味著中央要求上海進一步在政府改革、企業改革方面應該勇于爭當“排頭兵”，敢于“先行先試”。
目前，無論是“企業改革和改組”，還是“政府職能轉變和管理創新”，上海在這兩方面的改革依然正在推進之中。不過周振華認為，由于這兩項改革涉及多方利益且錯綜復雜，改革的過程可謂任重而道遠。
如何通過改革促進上海經濟發展整體轉型，如何落實“兩個中心”《意見》所賦予上海的歷史使命，如何讓上海的經濟在轉型之后更具活力，成為了上海在2020年建成“兩個中心”前必須解答的問題。
(配文)繼國際金融、國際航運“兩個中心”之后，第三個 “中心”目標已定——
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