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我國戰(zhàn)略生物資源大數(shù)據(jù)及應用

發(fā)布時間:2020-01-22 10:53:42  |  來源:中國網(wǎng)·中國發(fā)展門戶網(wǎng)  |  作者:梁卓 褚鑫 曾艷等  |  責任編輯:楊霄霄
關鍵詞:生物資源,信息化,大數(shù)據(jù)

 國內(nèi)外戰(zhàn)略生物資源數(shù)字化建設的現(xiàn)狀與進展

1.發(fā)達國家高度重視對生物資源的信息化建設和管理

在過去幾十年中,發(fā)達國家創(chuàng)建、存儲和連接生物多樣性數(shù)據(jù)庫的舉措激增。例如,英國國家生物多樣性網(wǎng)絡門戶①是一個收集、分類、分析和傳播英國生物多樣性數(shù)據(jù)的組織。歐洲建立了生物多樣性數(shù)據(jù)中心②,愛爾蘭和比利時也倡導了目的類似的國家計劃。長期監(jiān)測項目,如美國的長期生態(tài)研究網(wǎng)絡項目(LTER)④、美國國家科學基金會(NSF)出資?4?億美元建立的國家生態(tài)觀測網(wǎng)(NEON)⑤以及澳大利亞的陸地生態(tài)系統(tǒng)研究網(wǎng)絡(TERN)⑥等,正在提供長期標準化的生態(tài)和生物數(shù)據(jù)集的開放訪問。更雄心勃勃的國際基礎設施尋求將各國和各大洲的數(shù)據(jù)庫連接起來。全球生物多樣性信息設施(GBIF)是一個跨國、開放的數(shù)據(jù)基礎設施,用于匯集當?shù)睾筒煌瑏碓吹纳锒鄻有孕畔ⅲ壳耙寻?10?億多條物種分布信息。該設施“允許任何地方的任何人通過互聯(lián)網(wǎng)訪問跨越國界共享的關于地球上所有類型生命的數(shù)據(jù)”。同樣,由美國?NSF?資助的生態(tài)信息技術平臺DataONE(地球數(shù)據(jù)觀測網(wǎng)絡)⑧備受矚目;該項目目標是廣泛收集、存儲地球和環(huán)境有關數(shù)據(jù),在普及應用基礎上,創(chuàng)造新的知識。

館藏數(shù)字化已成為世界自然歷史館藏的關鍵活動之一。通過?NSF?資助推進的生物多樣性數(shù)字化(ADBC)項目,美國的保藏物數(shù)字化得到了加強。到?2020?年,美國博物館中數(shù)字化的標本總數(shù)可能超過?1?億件。

近年來,生物多樣性信息學快速發(fā)展,全球和區(qū)域水平的生物多樣性數(shù)據(jù)庫不斷建立和完善。若干國家水平的數(shù)據(jù)庫,如澳大利亞生物多樣性信息系統(tǒng)(ALA) ⑨已有超過?4?606?萬條記錄,美國標本數(shù)字化平臺(iDigBio)⑩有超過?9?500?萬條的數(shù)字化標本共享。全球生物信息的主要數(shù)據(jù)由美國的國家生物技術信息中心(NCBI)和歐洲生物信息研究所(EBI)等建立的數(shù)據(jù)庫控制。

2014?年啟動的世界植物在線(WFO)項目擴大了數(shù)字化工作和虛擬植物標本館的范圍。WFO?是根據(jù)《全球植物保護戰(zhàn)略》2020?年的主要目標開發(fā)的一個與世界其他?30?個機構合作的項目,旨在制作并呈現(xiàn)世界在線植物區(qū)系。這些數(shù)據(jù)通過虛擬植物標本館呈現(xiàn),并提供給?WFO?門戶網(wǎng)站;所有參與機構將向該網(wǎng)站提供其擁有的數(shù)字化植物描述。

2015?年,中國作為代表提出了亞洲生物多樣性數(shù)字化計劃(Mapping Asia Plants,MAP)。MAP?旨在建立亞洲植物學信息的大數(shù)據(jù)在線平臺,為亞洲植物多樣性保護與研究提供綜合性基礎信息和跨學科數(shù)據(jù)挖掘環(huán)境。與MAP?類似的項目為數(shù)不多,全球尺度上有?Map of Life(MOL)。MOL?旨在搜集和整合全球物種分布及其動態(tài)變化的數(shù)據(jù)和知識,為生物多樣性教育、保護、研究和科學決策服務。其理念是把生物多樣性畫在圖上(putting biodiversity on the map)。在區(qū)域尺度上,植物學信息與生態(tài)網(wǎng)絡(Botanical Information and Ecology Network,BIEN)提供了很好的參考案例。

2. 我國積極推動科技資源的整合共享與高效利用

為促進科技資源的有效利用和共享,我國科學技術部啟動了國家科技基礎條件平臺建設工作。自然科技資源和科學數(shù)據(jù)共享服務屬于平臺建設的主要內(nèi)容,植物種質(zhì)資源、動物種質(zhì)資源、微生物菌種資源、人類遺傳資源、實驗生物材料、生物標本、巖石礦物和化石標本等八大類自然資源的整合集成與共享成為自然科技資源平臺建設的重點。科學數(shù)據(jù)資源建設重點整合、集成各部門、各地方、各單位的科學數(shù)據(jù)資源,充分利用國際科學數(shù)據(jù)資源,搶救離散科學數(shù)據(jù)資源,開發(fā)系列數(shù)據(jù)集和產(chǎn)品,構建面向全社會的網(wǎng)絡化、智能化的科學數(shù)據(jù)管理與共享服務體系。

2018?年?2?月,為深入實施創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略,規(guī)范管理國家科技資源共享服務平臺,推進科技資源向社會開放共享,科學技術部、財政部印發(fā)《國家科技資源共享服務平臺管理辦法》。2018?年?4月,國務院辦公廳印發(fā)《科學數(shù)據(jù)管理辦法》,對戰(zhàn)略生物資源數(shù)據(jù)的規(guī)范管理具有重要的指導意義。2019?年?6?月?5?日,為落實《科學數(shù)據(jù)管理辦法》和《國家科技資源共享服務平臺管理辦法》的要求,規(guī)范管理國家科技資源共享服務平臺,科學技術部、財政部對原有國家科技資源共享服務平臺開展了優(yōu)化調(diào)整工作。通過部門推薦和專家咨詢,形成“國家微生物數(shù)據(jù)中心”等?20?個國家科學數(shù)據(jù)中心以及“國家重要野生植物種質(zhì)資源庫”等?30?個國家生物種質(zhì)與實驗材料資源庫。

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