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學(xué)科、地域分布合理的三層超算環(huán)境初具規(guī)模

2011年08月15日16:35 | 中國發(fā)展門戶網(wǎng) www.chinagate.cn | 給編輯寫信 字號:T|T
關(guān)鍵詞: 學(xué)科 地域 分布 三層 超算環(huán)境

中國發(fā)展門戶網(wǎng)8月15日電 日前,中國科學(xué)院編寫了《中國科學(xué)院信息化發(fā)展報告2011》。其中指出,學(xué)科、地域分布合理的三層超算環(huán)境初具規(guī)模。具體內(nèi)容如下:

初步形成了由院超級計算總中心、分中心及所級中心組成的三層架構(gòu)的科學(xué)計算網(wǎng)格環(huán)境,其中頂層計算能力達(dá)到143萬億次,聚合中間層的分中心和第三層的所級中心20個左右。

院超級計算中心作為總中心,部署了深騰7000超級計算機(jī)系統(tǒng),運算速度理論峰值達(dá)到每秒143萬億次,是目前國內(nèi)綜合性能最高的通用高性能超級計算機(jī)之一。該系統(tǒng)采用了創(chuàng)新的高性能異構(gòu)體系架構(gòu),突破了傳統(tǒng)高性能計算平臺的應(yīng)用限制,通過包含多種不同架構(gòu)服務(wù)器節(jié)點,從而滿足用戶多樣化的應(yīng)用需求。自2009年4月深騰7000投入正式使用以來,截至2010年12月底,已累計為用戶提供超過6,800萬CPU小時的機(jī)時服務(wù),支持了一大批國家863計劃、973計劃、國家自然科學(xué)基金、中國科學(xué)院知識創(chuàng)新重大項目和省部級等重大項目和計劃。中科院超級計算中心研究人員協(xié)助科學(xué)家們在各應(yīng)用領(lǐng)域作出了眾多出色的成果。

專欄7:鳳凰計劃

世界上精度最高的一組對宇宙最大自束縛系統(tǒng)—星系團(tuán)的數(shù)值模擬,將主要對暗物質(zhì)湮滅、星系團(tuán)暗暈的內(nèi)部結(jié)構(gòu)、星系團(tuán)暗物質(zhì)引力透鏡現(xiàn)象、星系團(tuán)的形成與演化進(jìn)行系列研究。該計劃利用深騰7000系統(tǒng)的1,024個計算核心,耗費約200萬個計算機(jī)時完成。

           

圖表 11.9個不同星系團(tuán)的密度分布   圖表 12.1e9粒子數(shù)目的其中

                                 一個星系團(tuán)模擬的密度分布



 

結(jié)合中科院超級計算應(yīng)用發(fā)展現(xiàn)狀及特定計算需求,按照“學(xué)科為主、地域為輔”的原則,在北京、上海、武漢、沈陽、蘭州、合肥、昆明、大連、青島等地部署了10個分中心。遍布全國、覆蓋各個主要地區(qū)計算需求的10家超級計算分中心具有各自鮮明的學(xué)科特色,成為超算環(huán)境的中堅力量。專欄 9:鋰離子摻雜介孔共軛高分子材料的儲氫研究大連化物所利用大連分中心的超級計算機(jī)系統(tǒng)開展計算化學(xué)方面的科學(xué)研究,以數(shù)值模擬手段,對鋰離子摻雜介孔共軛高分子材料的優(yōu)異儲氫性能進(jìn)行了研究,通過對鋰離子摻雜濃度進(jìn)行優(yōu)化,提高了其儲氫水平,有力地促進(jìn)了新材料、新能源的發(fā)現(xiàn)和發(fā)展。

專欄9:鋰離子摻雜介孔共軛高分子材料的儲氫研究

大連化物所利用大連分中心的超級計算機(jī)系統(tǒng)開展計算化學(xué)方面的科學(xué)研究,以數(shù)值模擬手段,對鋰離子摻雜介孔共軛高分子材料的優(yōu)異儲氫性能進(jìn)行了研究,通過對鋰離子摻雜濃度進(jìn)行優(yōu)化,提高了其儲氫水平,有力地促進(jìn)了新材料、新能源的發(fā)現(xiàn)和發(fā)展。

    

 

圖表14.鋰離子摻雜介孔共軛高分子材料的儲氫研究示意圖



 

在基層部署的園區(qū)級計算中心主要由研究所自建,以滿足研究所及周邊科研單位自身的計算需求為主,現(xiàn)已經(jīng)吸引了13個具有特色應(yīng)用的研究所加入,形成了中科院超算環(huán)境的堅實基礎(chǔ)。

專欄10:超算環(huán)境助力系統(tǒng)生物學(xué)、基因組學(xué)和大分子蛋白質(zhì)模擬領(lǐng)域交叉研究

北京基因組研究所是較早加入院超級計算環(huán)境的所級中心,該所利用院超級計算環(huán)境的資源對α/β類型小酸性可溶性蛋白(SASP)DNA結(jié)合模式進(jìn)行了科學(xué)探索。在系統(tǒng)生物學(xué)、基因組學(xué)和大分子蛋白質(zhì)模擬領(lǐng)域形成了跨領(lǐng)域、交叉學(xué)科的前沿性研究,促進(jìn)了我國綠色生物農(nóng)藥的可持續(xù)性發(fā)展。

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圖表15.小酸性可溶性蛋白(SASP)DNA結(jié)合模式研究示意圖



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