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全球首個心臟細胞器蛋白質圖譜庫建成

2013年11月08日10:56 | 中國發展門戶網 www.chinagate.cn | 給編輯寫信 字號:T|T
關鍵詞: 心臟細胞器 細胞器蛋白 蛋白質圖 質圖譜庫 組學 研究人員

中外研究人員經3年多努力,合作創建了全球首個統一標準的心臟細胞器蛋白質圖譜庫,在心臟蛋白質組生物信息學研究方面取得重要進展。該研究把心臟生物學基礎研究和臨床心臟醫學研究兩大領域連為一體,對促進心臟轉化醫學研究有重要意義。相關論文近日在線發表在《循環研究》雜志上。

蛋白質是與生命及各種形式的生命活動緊密聯系在一起的物質,越來越多的組學技術(基因組學、蛋白質組學和代謝組學等)研究在心血管生物領域中已廣泛應用,尤其是科學家在大規模蛋白質組學研究中已發現許多以前沒有發現的規律,有些規律對解釋心臟細胞在生理或病理狀態下的運作機制有重要意義。但蛋白質組學研究存在標識、對比參照物不統一等問題,而心臟細胞器蛋白質圖譜庫的建立將有助于解決這些難題。

該研究由復旦大學附屬中山醫院特聘教授、美國加州大學洛杉磯分校戴衛·格芬醫學院心臟病學專家平琲琲教授及其研究團隊,與復旦大學附屬中山醫院心血管病研究所葛均波院士研究團隊及歐洲生物信息學研究所等合作完成。

論文共同第一作者、復旦大學附屬中山醫院心血管病研究所李華博士介紹,全球首個心臟細胞器蛋白質圖譜庫是一個全球共享平臺,具有實時更新數據的功能,可將不同學科間的資源進行整理,從而有利于研究人員在特定生物背景下從事蛋白信號通路的深入研究。心臟細胞器蛋白質圖譜庫平臺具有三大優勢,一是設有很多已經整合過的重要數據,設有專為研究人員設計的寬泛、快速鑒定蛋白的搜索引擎;二是含有一個數據庫和一套生物信息工具,可用來整合已知生物醫學特征(如基因突變及疾病表型等);三是實時在線,有利于研究人員高效分析、上傳和查詢相關數據。記者 孫國根

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