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西藏成功繪制出全球首個青稞基因組圖譜

2014年03月05日14:31 | 中國發展門戶網 www.chinagate.cn | 給編輯寫信 字號:T|T
關鍵詞: 青稞 基因組大小 基因組圖譜 西藏自治區農牧科學院 裸大麥

西藏自治區農牧科學院與華大科技2日向新華社記者透露,繼全球首個大麥基因繪制成功后不久,他們率先在世界上完成青稞基因組圖譜的繪制。該項科研成果將為深入揭示西藏青稞起源、馴化及栽培選育過程等提供堅實的遺傳學基礎。

青稞,在藏語中稱為“乃”,在分類學上是一種裸大麥。青稞在青藏高原經過3500—4000年的馴化栽培,已經適應高原極端氣候。西藏是全球唯一大規模集中種植青稞的地區,同時也是青稞的馴化和多樣化品種栽培中心。

基于青稞的重要性和豐富的種質資源,2012年,西藏自治區農牧科學院與全球知名的基因組學研究機構——華大科技,共同啟動了青稞全基因組圖譜及重測序合作項目。

研究人員經過2年多的科研攻關,目前,青稞基因組圖譜已繪制完成。據介紹,用于基因組圖譜構建的青稞品種是西藏古老的地方品種“拉薩鉤芒”。研究顯示:青稞基因組大小估算為4.5Gbp(bp是基因大小單位,即堿基對),組裝基因組大小3.89Gbp,共包含39197個蛋白編碼基因。

由于青稞基因組重復含量很高,達到80%以上,為了達到理想的組裝效果,研究人員進行了高測序深度的全基因組測序。此外,研究人員還將青稞與小麥A、D、水稻、高粱、玉米等單子葉植物做了比較分析,通過構建系統發育樹,研究基因擴張情況,從比較基因組方向進一步解析青稞的生物學特質,為后續優良栽培品種選育、青稞產業發展奠定基礎。

此項研究的首席專家——西藏自治區農牧科學院副院長、研究員尼瑪扎西說:“成功繪制青稞基因組圖譜,并完成解析,這在世界上還是首次。這項研究對中國的青稞產業發展意義重大,借助它將有望培育出比青稞新品種‘藏青2000’更為優異的青稞品種,從而進一步提升青稞的產量。”

青稞是藏族群眾的主食,種植面積占西藏糧食作物的70%。近年來,西藏不斷加大青稞育種研究,2013年西藏示范推廣播種10.6萬畝青稞新品種“藏青2000”,有效助推了青稞產量的增長,全年青稞產量達66萬多噸,創近十年新高。

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